MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinosynnema mirum DSM 43827 chromosome

Total Repeats: 259223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013093	TGGTGC	2	12	202582	202593	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256374348
6002	NC_013093	GC	3	6	202662	202667	0 %	0 %	50 %	50 %	256374348
6003	NC_013093	GCG	3	9	202728	202736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374348
6004	NC_013093	GTC	2	6	202764	202769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374348
6005	NC_013093	CCG	2	6	202851	202856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374349
6006	NC_013093	AGA	2	6	202869	202874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256374349
6007	NC_013093	GCG	2	6	202971	202976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374349
6008	NC_013093	CCA	2	6	202980	202985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374349
6009	NC_013093	CCGC	2	8	203010	203017	0 %	0 %	25 %	75 %	256374349
6010	NC_013093	GCG	2	6	203030	203035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374349
6011	NC_013093	CCAC	2	8	203109	203116	25 %	0 %	0 %	75 %	256374349
6012	NC_013093	GCCTGC	2	12	203117	203128	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256374349
6013	NC_013093	CGG	2	6	203180	203185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374349
6014	NC_013093	ACCGC	2	10	203201	203210	20 %	0 %	20 %	60 %	256374349
6015	NC_013093	CAC	2	6	203245	203250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374349
6016	NC_013093	CCG	2	6	203275	203280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374349
6017	NC_013093	CAC	2	6	203314	203319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374349
6018	NC_013093	GGT	2	6	203341	203346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374349
6019	NC_013093	CGG	2	6	203373	203378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374349
6020	NC_013093	GGT	2	6	203388	203393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374349
6021	NC_013093	GCC	2	6	203417	203422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374349
6022	NC_013093	CCG	2	6	203429	203434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374349
6023	NC_013093	GC	3	6	203465	203470	0 %	0 %	50 %	50 %	256374349
6024	NC_013093	CGGG	2	8	203487	203494	0 %	0 %	75 %	25 %	256374349
6025	NC_013093	CGGAT	2	10	203526	203535	20 %	20 %	40 %	20 %	256374349
6026	NC_013093	GGT	2	6	203556	203561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374349
6027	NC_013093	ACCG	2	8	203583	203590	25 %	0 %	25 %	50 %	256374349
6028	NC_013093	CGG	2	6	203663	203668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374349
6029	NC_013093	CCA	2	6	203679	203684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374349
6030	NC_013093	CTC	2	6	203736	203741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374350
6031	NC_013093	TCC	2	6	203755	203760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374350
6032	NC_013093	TCG	2	6	203767	203772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374350
6033	NC_013093	TGG	2	6	203789	203794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374350
6034	NC_013093	CGG	2	6	203878	203883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374350
6035	NC_013093	TCG	2	6	203932	203937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374350
6036	NC_013093	CCT	2	6	204046	204051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_013093	CTG	2	6	204063	204068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_013093	TGC	2	6	204270	204275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374351
6039	NC_013093	CG	3	6	204314	204319	0 %	0 %	50 %	50 %	256374351
6040	NC_013093	CTG	2	6	204335	204340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374351
6041	NC_013093	CGC	2	6	204364	204369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374351
6042	NC_013093	GCC	2	6	204386	204391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374351
6043	NC_013093	CG	3	6	204398	204403	0 %	0 %	50 %	50 %	256374351
6044	NC_013093	GC	3	6	204490	204495	0 %	0 %	50 %	50 %	256374351
6045	NC_013093	CGG	3	9	204584	204592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374351
6046	NC_013093	CCCT	2	8	204624	204631	0 %	25 %	0 %	75 %	256374351
6047	NC_013093	CTG	2	6	204635	204640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374351
6048	NC_013093	GCT	2	6	204703	204708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374351
6049	NC_013093	CGC	2	6	204724	204729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374351
6050	NC_013093	GGCCT	2	10	204734	204743	0 %	20 %	40 %	40 %	256374351
6051	NC_013093	TCGA	2	8	204773	204780	25 %	25 %	25 %	25 %	256374351
6052	NC_013093	CGCC	2	8	204907	204914	0 %	0 %	25 %	75 %	256374351
6053	NC_013093	CGGCT	2	10	204943	204952	0 %	20 %	40 %	40 %	256374351
6054	NC_013093	CCGC	2	8	205023	205030	0 %	0 %	25 %	75 %	256374351
6055	NC_013093	CCG	2	6	205069	205074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374351
6056	NC_013093	CGA	2	6	205107	205112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374351
6057	NC_013093	ACG	2	6	205125	205130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374351
6058	NC_013093	CGC	2	6	205132	205137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374351
6059	NC_013093	CCGGC	2	10	205270	205279	0 %	0 %	40 %	60 %	256374351
6060	NC_013093	GC	4	8	205285	205292	0 %	0 %	50 %	50 %	256374351
6061	NC_013093	CGC	2	6	205304	205309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374351
6062	NC_013093	GAC	2	6	205351	205356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374351
6063	NC_013093	CCG	2	6	205378	205383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374351
6064	NC_013093	CTGA	2	8	205428	205435	25 %	25 %	25 %	25 %	256374351
6065	NC_013093	GAG	2	6	205605	205610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_013093	GCG	2	6	205647	205652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_013093	CATT	2	8	205684	205691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6068	NC_013093	CTGA	2	8	205726	205733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6069	NC_013093	CACCGC	2	12	205824	205835	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_013093	CGC	2	6	205886	205891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6071	NC_013093	AGCG	2	8	205917	205924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_013093	CCG	2	6	206000	206005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_013093	CGC	2	6	206009	206014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_013093	CCCG	2	8	206041	206048	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6075	NC_013093	CGCC	2	8	206076	206083	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6076	NC_013093	TGTGGG	2	12	206134	206145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_013093	GC	3	6	206218	206223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6078	NC_013093	ACC	2	6	206244	206249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6079	NC_013093	AC	3	6	206286	206291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6080	NC_013093	GGA	2	6	206356	206361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_013093	GGA	2	6	206383	206388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_013093	AAC	2	6	206398	206403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256374352
6083	NC_013093	GCC	2	6	206423	206428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374352
6084	NC_013093	GCC	2	6	206432	206437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374352
6085	NC_013093	CCAG	2	8	206481	206488	25 %	0 %	25 %	50 %	256374352
6086	NC_013093	CGG	4	12	206512	206523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374352
6087	NC_013093	TCG	2	6	206553	206558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374352
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6089	NC_013093	TCG	2	6	206694	206699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374352
6090	NC_013093	GGC	2	6	206717	206722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374352
6091	NC_013093	GGC	2	6	206767	206772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374352
6092	NC_013093	CCG	3	9	206826	206834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374352
6093	NC_013093	GCC	3	9	206840	206848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374352
6094	NC_013093	TCG	2	6	206865	206870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374352
6095	NC_013093	GTC	2	6	206888	206893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374352
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6099	NC_013093	CCCG	2	8	206940	206947	0 %	0 %	25 %	75 %	256374352
6100	NC_013093	CGA	2	6	206962	206967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374352
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6103	NC_013093	GC	3	6	206991	206996	0 %	0 %	50 %	50 %	256374352
6104	NC_013093	AGGGCG	2	12	207015	207026	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	256374352
6105	NC_013093	ACCCGG	3	18	207036	207053	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256374352
6106	NC_013093	GACCCG	2	12	207059	207070	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256374352
6107	NC_013093	CGC	2	6	207120	207125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374352
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6110	NC_013093	CCGG	2	8	207443	207450	0 %	0 %	50 %	50 %	256374352
6111	NC_013093	GCA	2	6	207474	207479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374352
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6113	NC_013093	ACT	2	6	207519	207524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374352
6114	NC_013093	TCG	2	6	207546	207551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374352
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6118	NC_013093	CG	4	8	207634	207641	0 %	0 %	50 %	50 %	256374352
6119	NC_013093	GCC	2	6	207681	207686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374352
6120	NC_013093	CAAGGC	2	12	207688	207699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374352
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6122	NC_013093	CGG	2	6	207781	207786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374352
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6124	NC_013093	GC	3	6	207813	207818	0 %	0 %	50 %	50 %	256374352
6125	NC_013093	G	6	6	207826	207831	0 %	0 %	100 %	0 %	256374352
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6247	NC_013093	GC	3	6	211834	211839	0 %	0 %	50 %	50 %	256374355
6248	NC_013093	CGA	2	6	211897	211902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374355
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6250	NC_013093	GC	3	6	212001	212006	0 %	0 %	50 %	50 %	256374355
6251	NC_013093	CGCC	2	8	212008	212015	0 %	0 %	25 %	75 %	256374355
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6263	NC_013093	GTC	2	6	212246	212251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374355
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6322	NC_013093	AGCGG	2	10	214530	214539	20 %	0 %	60 %	20 %	256374357
6323	NC_013093	CGT	2	6	214546	214551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374357
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6347	NC_013093	CGGG	2	8	215723	215730	0 %	0 %	75 %	25 %	256374358
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6355	NC_013093	TCA	2	6	215995	216000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374358
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6364	NC_013093	CACC	2	8	216134	216141	25 %	0 %	0 %	75 %	256374358
6365	NC_013093	C	6	6	216161	216166	0 %	0 %	0 %	100 %	256374358
6366	NC_013093	GC	4	8	216176	216183	0 %	0 %	50 %	50 %	256374358
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6491	NC_013093	CAG	2	6	220074	220079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6492	NC_013093	AGA	2	6	220107	220112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6493	NC_013093	CAG	2	6	220133	220138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6494	NC_013093	ATT	2	6	220174	220179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6495	NC_013093	AGG	2	6	220323	220328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6496	NC_013093	GAG	2	6	220372	220377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6497	NC_013093	GGTG	2	8	220432	220439	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6498	NC_013093	TCC	2	6	220462	220467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6499	NC_013093	GCG	2	6	220554	220559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6500	NC_013093	GAA	2	6	220588	220593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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